Eine stärkere Marktintegration ist eines der wesentlichen strategischen Ziele der E-Control. Zu den damit verbundenen Vorteilen gehört die Erhöhung der Versorgungssicherheit durch Marktintegration, der verbesserte Zugang zu den Beschaffungsmärkten und eine stärkere Angleichung der Endverbraucherpreise, die für die Standortneutralität der Unternehmen wesentlich ist.
Zu den gesetzlichen Aufgaben der E-Control zählt auch die Mitwirkung an der Zusammenarbeit zum Zweck der Weiterentwicklung des europäischen Energiebinnenmarktes. Die E-Control unterstützt die EU-Kommission bei ihren Bemühungen um eine verstärkte Marktintegration bei der Setzung der Rahmenbedingungen. Die E-Control kommt dieser Aufgabe vor allem durch die aktive Mitarbeit im Council of European Energy Regulators (CEER) und in der Agency for the Cooperation of Energy Regulators (ACER) nach. CEER, eine non-for-profit Organisation, ist die Stimme der europäischen Regulierungsbehörden für Strom und Gas auf EU und internationaler Ebene und fördert den Austausch bewährter Praktiken zwischen den Regulierungsbehörden. Die Ergebnisse der CEER Arbeiten sind meist Positionspapiere oder sog. „Guidelines of Good Practice“ (GGP). Diese sind in der Regel nicht unmittelbar juristisch verbindlich. Trotzdem kann die Einhaltung einem Monitoring unterzogen werden und Elemente daraus können relativ einfach in zukünftige, verbindliche Regelwerke übergeführt werden.
Im Rahmen des 3. Energie-Binnenmarktpakets wurde ACER gegründet. Das wesentliche Ziel von ACER ist die Vollendung des Energiebinnenmarkts für Strom und Gas . Als unabhängige europäische Institution fördert sie nicht nur die Zusammenarbeit der europäischen Energieregulierungsbehörden, sondern stellt gleichzeitig sicher, dass sowohl die Marktintegration als auch die Harmonisierung der Regulierungsrahmen im Einklang mit den energiepolitischen Zielen der EU erreicht werden.
Weiters ist die E-Control in der Energiegemeinschaft aktiv. Als sogenannter „Participant“ im Energy Community Regulatory Board (ECRB) ist die E-Control bemüht, die Umsetzung des EU Energie acquis communautaire auch in Südosteuropa aktiv voranzutreiben.
